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二手基因測序儀 二代中三*性能PK

更新時間:2020-05-22      點擊次數(shù):4694

二手基因測序儀 是測序產(chǎn)業(yè)鏈的起點也是關(guān)鍵環(huán)節(jié),它為整個中下游測序服務(wù)提供基本的測序支撐,同時也處于基因測序產(chǎn)業(yè)價值鏈頂端?;驕y序儀對于基因產(chǎn)業(yè)的重要性,如同發(fā)動機之于汽車行業(yè),芯片之于電子通信行業(yè)。

 

基因測序也稱DNA測序,是現(xiàn)代生物學(xué)研究中重要的手段之一?;驕y序技術(shù)經(jīng)過了三個發(fā)展階段。

 

一代測序:指雙脫氧末端終止法,擴增后通過毛細(xì)管電泳讀取序列,每次獲取數(shù)據(jù)量少。

 

二代測序:為高通量測序,采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序,代表有454,Solexa,SOLID,高通量,可一次獲得數(shù)G數(shù)據(jù),相對與第三代,都仍然需要擴增的方法放大信號,擴增后再檢測。

 

三代測序:特點是單分子測序,多基于納米科技,無需擴增,對單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過納米孔等方源式直接測序,核心特點是無需擴增所以成本更低。

 

二手基因測序儀 二代技術(shù)中有哪些品牌突出?有哪些性能優(yōu)勢?

 

Roche公司的454測序平臺、Illumina公司的Solexa測序系統(tǒng)以及ABI公司的SOLID測序系統(tǒng)標(biāo)志著二代測序技術(shù)誕生。盡管各系統(tǒng)在高通量水平、測序準(zhǔn)確度、存儲格式、技術(shù)方法上各有差異,但共同特征是大大降低了測序成本并大大地提高了測序速度,完成一個人的基因組測序只需一周左右時間。然而二代測序技術(shù)在測序前要通過PCR段對待測片段進(jìn)行擴增,增加了測序的錯誤率。而且二代測序產(chǎn)生的測序結(jié)果長度較短,需要對測序結(jié)果進(jìn)行人工拼接,因此比較適合于對已知序列的基因組進(jìn)行重新測序,而在對全新的基因組進(jìn)行測序時還需要結(jié)合一代測序技術(shù)。

 

簡而言之: Roche 454是焦磷酸測序; illumina Solexa是合成法測序; ABI SOLID是連接法測序。

 

就讀長來看: Roche 454 > illumina Solexa > ABI SOLID。

 

就Reads數(shù)來看: ABI SOLID > illumina Solexa > Roche 454。

 

就應(yīng)用來看: Roche 454讀長較長,便于拼接 ,因此在denovo測序方面有很大優(yōu)勢;ABI SOLID雖然讀長很短,但是Reads數(shù)多,而且ABI的色球編碼技術(shù),使得每個堿基都會被讀取兩遍,準(zhǔn)確率很腐, 因此ABI SOL心在檢測SNP、轉(zhuǎn)錄組測序、ChIP-Seq等方面很有優(yōu)勢;illumina Solexa的讀長和Reads數(shù)均位于中間,比較適合于基因組重測序。而在實際應(yīng)用中 ,由千Roche 454成本太商,因此illumina Solexa 也被較多的應(yīng)用于denovo測序。

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